Στο Τμήμα Φυσικής υπάρχουν πέντε (5) Τομείς στους οποίους κατανέμεται το ανθρώπινο δυναμικό καθώς και οι εκπαιδευτικές και ερευνητικές δραστηριότητες του Τμήματος. Οι Τομείς αυτοί είναι οι ακόλουθοι:
Α : Φυσικής Συμπυκνωμένης Ύλης
Β : Πυρηνικής Φυσικής και Φυσικής Στοιχειωδών Σωματιδίων
Γ : Αστροφυσικής, Αστρονομίας, Μηχανικής
Δ : Φυσικής Περιβάλλοντος – Μετεωρολογίας
Ε : Ηλεκτρονικής Φυσικής και Συστημάτων
Στο Τμήμα Φυσικής λειτουργούν τα ακόλουθα Εργαστήρια:
Επιπλέον λειτουργούν και τα ακόλουθα Ερευνητικά Πανεπιστημιακά Ινστιτούτα (ΕΠΙ) :